香港科學園地處香港中心點，位於市區和中國大陸邊界的交匯點，位置優越，交通便利。
由大學港鐵站乘搭272K只需5分鐘；
由沙田港鐵站（排頭街近宜家傢俬）乘搭27號小巴只需10分鐘；
科學園第二期停車場設有600 個車位，周一至五消費滿HK$100，可享2小時免費泊車，最多可享4小時免費泊車；周六、日及公眾假期消費滿HK$100即享4小時免費泊車；
電動車可享用免費泊車及充電服務；
園區亦提供單車泊位。

九龍巴士(九巴)

• 272K - 往返港鐵大學站及香港科學園
• 272S - 往返港鐵鑽石山站及香港科學園
• 43P - 往返港鐵荃灣西站巴士總站及香港科學園

27號專線小巴(16座位)往返港鐵沙田站（排頭街）及香港科學園，訪客可每天從上午6時25分至下午11時15分，乘坐小巴往返科學園。票價為6.6元。